MySQL Server desapareceu - exatamente em 60 segundos

Neste cenário, uma consulta MySQL que estava sendo executada anteriormente com sucesso agora está enfrentando um tempo limite após 60 segundos, exibindo o erro "O servidor MySQL foi embora". O problema persiste mesmo que a variável wait_timeout tenha sido ajustada.

Análise:

O fato de o tempo limite ocorrer precisamente em 60 segundos sugere que uma configuração em vez de recursos limitados é a causa. Isso é apoiado pela observação de que a execução da mesma consulta diretamente de um cliente MySQL é bem-sucedida.

Solução:

A causa raiz do problema é a opção PHP mysql.connect_timeout. Esta opção determina o tempo que o cliente PHP aguarda pela primeira resposta do servidor MySQL, não apenas o tempo limite da conexão.

Para resolver o problema, aumente o valor de mysql.connect_timeout da seguinte forma:

ini_set('mysql.connect_timeout', 300);
ini_set('default_socket_timeout', 300); 

Explicação:

Ao aumentar o valor de mysql.connect_timeout, você estende o tempo que o PHP espera pela resposta inicial do servidor, permitindo que a consulta seja executada totalmente dentro dos 60 -segunda janela.