Compreendendo o erro: "ValueError: não é possível reindexar a partir de um eixo duplicado"

Nos pandas, o "ValueError: não é possível reindexar a partir de um eixo duplicado" eixo" é encontrado ao tentar reindexar ou atribuir dados ao longo de um eixo que contém valores duplicados. Esse problema surge ao unir ou atribuir dados a uma coluna/linha que possui valores de índice duplicados.

Aplicando o conceito ao exemplo

No exemplo fornecido, o usuário está tentando definir o valor do índice 'somas' como a soma de todas as colunas no DataFrame affinity_matrix. No entanto, o erro é gerado porque há um valor duplicado em affinity_matrix.columns, que não é exibido no trecho de código fornecido.

Este valor duplicado cria um conflito ao tentar reindexar ou atribuir dados ao longo das colunas eixo. Para resolver esse problema, é necessário garantir que os valores de índice no DataFrame sejam únicos antes de executar tais operações.

Testando com um exemplo simplificado

Vamos usar um exemplo simplificado exemplo para ilustrar melhor o erro:

import pandas as pd
import numpy as np

a = np.arange(35).reshape(5, 7)
df = pd.DataFrame(a, ['x', 'y', 'u', 'z', 'w'], range(10, 17))
df.loc['sums'] = df.sum(axis=0)  # Assume that 'sums' is already an index value

# This would result in the ValueError, as 'sums' is a duplicate index value

O erro ocorre porque o DataFrame 'df' já possui um valor de índice 'sums' nas linhas e tenta criar um novo valor de índice com o mesmo nome resulta em um eixo duplicado.

Conclusão

O erro "ValueError: não é possível reindexar a partir de um eixo duplicado" serve como um lembrete para garantir a exclusividade de valores de índice em um DataFrame. Não fazer isso pode levar a problemas ao executar operações ao longo de eixos específicos, como reindexar ou atribuir dados.