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MPI で 2D 配列を効果的に送受信するにはどうすればよいですか?

2024 年 12 月 22 日に公開
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How to Effectively Send and Receive 2D Arrays in MPI?

MPI を使用した 2D 配列の送受信

問題:

複数にまたがる処理を必要とする大規模な 2D マトリックスがあります。 MPI を使用するノード。ノード間の唯一の通信には、各タイム ステップ後のエッジ値の共有が含まれます。

アプローチ:

質問で概説されている、提案されたアプローチは、この問題に適しています。次のコード セグメントは、推奨される実装を示しています:

// (assume A is a 2D array)
if (myrank == 0) {
  for (i = 0; i 

追加の MPI 関数:

  • MPI_Allgather: すべてのプロセッサからアクセスできるバッファにデータをすべてのプロセッサから収集します。分散配列を単一のプロセッサに収集する場合に便利です。
  • MPI_Alltoall: すべてのプロセッサ間でのデータの完全な交換を提供します。
  • MPI_Sendrecv: A送信と受信をひとつにまとめた便利な機能call.
  • MPI_Buffer_attach: 明示的にメモリを割り当てる必要がなく、バッファをプロセスにアタッチします。

考慮事項:

  • MPI を簡素化するために 2D 配列には連続したメモリ割り当てを推奨しますcommunication.
  • MPI_Barrier はプロセス間の同期を保証しますが、MPI_Wait や MPI_Test などの非ブロッキング代替手段に置き換えることもできます。
  • ここではブロッキング送受信が使用されていますが、非ブロッキング オプションも利用できます。効率を高めます。
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